1、工程量計算規則有不同。比如土方工程挖基礎土方：清單是按圖標尺寸凈量計算（不包括放坡及工作面開挖量），定額是按實際開挖量計量（包括放坡及工作面開挖量）。
　　2、清單計價以“清單項目”作為“基本單位”計算工程造價，清單項目組合了特定工作內容的消耗量子目。清單項目有點類似于以前96的綜合定額，但綜合定額內的子目及綜合系數相對固定，而清單項目則由投標人自行組合消耗量定額。
　　3、對于“組織措施費”，清單計價將它作為一組“措施清單項”，在套價庫窗口計列。定額計價在取費表里作為一項費用計取。
　　4、輸出表格要求不同。清單計價以“清單項目”為計算單位，列出“工程量清單報價表”，“清單項綜合單價分析表”，“總價表”等；定額計價以定額子目為計算單位，列出“工  程預算表”，“造價取費表”等。
　　5、安全文明施工費、價差的計費基數不同。上級行業管理費的計算費率不同。